Transitivity of COVID-19, based on parameters R_0 and R_((t)) in Pombos/PE municipality, Brazil

Authors

DOI:

https://doi.org/10.33448/rsd-v9i10.8441

Keywords:

COVID-19; Effective reproductive number; Infectivity; SARS-Cov-2; Stabilization; Zoonosis.

Abstract

Objetivo: Analisar a estimativa do número reprodutivo efetivo  da Síndrome Respiratória Aguda Grave desencadeada pelo novo Coronavírus (SARS-Cov-2), no município de Pombos/PE, Brasil, vinculados a datas em 2020. Método: Utilizaram-se dados de número de casos confirmados do SARS-Cov-2, disponibilizado através dos boletins epidemiológicos publicados pela Secretaria de Saúde de Pombos/PE, Brasil. O  determina o potencial de propagação de um vírus sob certas condições. Resultados: Os resultados demonstram que, até 22 de julho de 2020, as medidas preventivas e orientação de saúde não foram suficientes para reduzir a infectividade da doença no município ( > 1), sendo um novo desafio a ser enfrentado por quem atua no combate da COVID-19. Conclusão: Os resultados fornecem avaliações quantitativas ao município de Pombos/PE, Brasil, norteando em medidas de intervenções que podem ser realizadas por outros municípios ao lidar com surtos futuros, novas ondas crescentes.

References

Ainslie, K. E. et al. (2020). Evidence of initial success for China exiting COVID-19 social distancing policy after achieving containment. Wellcome Open Research, 5(81).

Ahmed, S. F., Quadeer, A. A., & McKay, M. R. (2020). Preliminary Identification of Potential Vaccine Targets for the COVID-19 Coronavirus (SARS-CoV-2) Based on SARS-CoV Immunological Studies. Viruses, 12(3), 254. doi: 10.3390/v12030254

Barros, D. M., da Silva Alves, D. A. N., Nascimento, G., Falcão, R. E. A., Cunha Filho, M., & Leite, R. M. B. (2020). Covid-19: Estudo da infectividade no Município de Garanhuns-PE. Research, Society and Development, 9(9), e298997176-e298997176. doi:10.33448/rsd-v9i9.7176

Becker, N. G., Glass, K., Barnes, B., Caley, P., Philp, D., McCaw, J. M., ... & Wood, J. (2006). Using mathematical models to assess responses to an outbreak of an emerged viral respiratory disease. Final Report to the Australian Government Department of Health and Ageing. National Centre for Epidemiology and Population Health, Australian National University.

Cori, A. et al. (2013). A new framework and software to estimate time-varying reproduction numbers during epidemics. American Journal of epidemiology, 178(9), 1505-1512.

Delamater, P. L., Street, E. J., Leslie, T. F., Yang, Y. T., & Jacobsen, K. H. (2019). Complexity of the basic reproduction number (R0). Emerging infectious diseases, 25(1), 1.

Durbin, J., & Koopman, S. J. (2012). Time series analysis by state space methods. 2nd ed. Oxford: Oxford University Press, 346.

Gupta, M. et al. (2020). Transmission dynamics of the COVID-19 epidemic in India and modelling optimal lockdown exit strategies. medRxiv.

Instituto Brasileiro de Geografia e Estatística –IBGE, Censo Demográfico (2010). Aglomerados subnormais. Primeiros resultados. Rio de Janeiro: Ministério do Planejamento, Orçamento e Gestão Instituto Brasileiro de Geografia e Estatística (IBGE), 1-251.

Islam, M. R., Hoque, M. N., Rahman, M. S., Alam, A. S. M. R. U., Akther, M., Puspo, J. A., Akter, S., Sultana, M., Crandall, K. A., & Hossain, M. A. (2020). Genome-wide analysis of SARS-CoV-2 virus strains circulating worldwide implicates heterogeneity. Scientific Reports, 10(1), 14004. doi: 10.1038/s41598-020-70812-6

Fiorillo, F. P. A. P., & Ferreira, M. F. F. (2016). Tutela jurídica da saúde ambiental em face dos aglomerados subnormais no Brasil. Revista Direito & Paz, 2(35), 3-20.

Latinne, A., Hu, B., Olival, K. J., Zhu, G., Zhang, L., Li, H., Chmura, A. A., Field, H. E., Zambrana-Torrelio, C., Epstein, J. H., Li, B., Zhang, W., Wang, L.-F., Shi, Z.-L., & Daszak, P. (2020). Origin and cross-species transmission of bat coronaviruses in China. Nature Communications, 11(1), 4235. doi: 10.1038/s41467-020-17687-3

Li, W., Shi, Z., Yu, M., Ren, W., Smith, C., Epstein, J. H., Wang, H., Crameri, G., Hu, Z., Zhang, H., Zhang, J., McEachern, J., Field, H., Daszak, P., Eaton, B. T., Zhang, S., & Wang, L. F. (2005). Bats are natural reservoirs of SARS-like coronaviruses. Science, 310(5748), 676–679. doi: 10.1126/science.1118391

Lotka, A. J. (1939). Théorie analytique des associations biologiques. 2nd ed. Hermann, Paris, 149.

Keeling, M. J., & Grenfell, B. T. (2000). Individual-based Perspectives on R0. Journal of Theoretical Biology, 203(1), 51–61. doi:10.1006/jtbi.1999.1064

Moirano, G., Schmid, M., & Barone-Adesi, F. (2020). Short-term effects of mitigation measures for the containment of the COVID-19 outbreak: an experience from Northern Italy. Disaster Medicine and Public Health Preparedness, 1-2.

Moon, S. G. et al. (2020). Time variant reproductive number of COVID-19 in Seoul, Korea. Epidemiology and Health, e2020047.

Muñoz, C. A. A., Montoya, J. F. A., & Loaiza, A. M. (2016). A Simulation Model with Community Structure for the Dengue Control. Applied Mathematical Sciences, 10(16), 787-794.

Najafi, F. et al. (2020). Serial interval and time-varying reproduction number estimation for COVID-19 in western Iran. New microbes and new infections, 36, 100715.

Nishiura, H., & Chowell, G. (2009). The effective reproduction number as a prelude to statistical estimation of time-dependent epidemic trends. In Mathematical and statistical estimation approaches in epidemiology (pp. 103-121). Springer, Dordrecht.

Nishiura, H., Linton, N. M., Akhmetzhanov, A. R. (2020). Serial interval of novel coronavirus (COVID-19) infections. International Journal of Infectious Diseases, 93, 284-286.

Nogueira, A. L., Nogueira, L., Zibetti, A., Roqueiro, N., Bruna-Romero, O., & Carciofi, B. A. (2020). Estimativa da Subnotificação de Casos da Covid-19 no Estado de Santa Catarina. UFSC.

Pan, A. et al. (2020). Association of public health interventions with the epidemiology of the COVID-19 outbreak in Wuhan, China. Jama, 323(19), 1915-1923. doi:10.1001/jama.2020.6130

Pereira, A. S.; Shitsuka, D. M.; Parreira, F. J.; Shitsuka, R (2018). Metodologia da pesquisa científica. 1. Ed. Santa Maria, RS: UFSM, NTE.

Pimentel, A. D. S. G., Maués, H. P., Lima, N. C. F. D., & Junior, G. F. D. A. (2020). Orientações da Psicologia brasileira em relação a prevenção da Covid19. Revista do NUFEN, 12(2), 102-117. doi:10.26823/RevistadoNUFEN.vol12.nº02artigo68

Prete, C. A. et al. Serial Interval Distribution of SARS-CoV-2 Infection in Brazil. medRxiv, 2020.

Rahman, M. S., Hoque, M. N., Islam, M. R., Akter, S., Rubayet-Ul-Alam, A., Siddique, M. A., Saha, O., Rahaman, M. M., Sultana, M., Crandall, K. A., & Hossain, M. A. (2020). Epitope-based chimeric peptide vaccine design against S, M and E proteins of SARS-CoV-2 etiologic agent of global pandemic COVID-19: an in silico approach. PeerJ, 8, e9572. doi: 10.7717/peerj.9572

Schmeller, D. S., Courchamp, F., & Killeen, G. (2020). Biodiversity loss, emerging pathogens and human health risks. Biodiversity and Conservation. doi: 10.1007/s10531-020-02021-6

Senel, K. et al. (2020). Instantaneous R for COVID-19 in Turkey: Estimation by Bayesian Statistical Inference. Turkiye Klinikleri Journal of Medical Sciences.

Shapiro, S. S., & Wilk, M. B. (1965). An analysis of variance test for normality (complete samples). Biometrika, 52(3/4), 591-611.

Thompson, R. N. et al. (2019). Improved inference of time-varying reproduction numbers during infectious disease outbreaks. Epidemics, 29, 100356.

Velavan, T. P., & Meyer, C. G. (2020). The COVID-19 epidemic. Tropical Medicine and International Health, 25(3), 278–280. doi: 10.1111/tmi.13383

Wallinga, J., & Teunis, P. (2004). Different epidemic curves for severe acute respiratory syndrome reveal similar impacts of control measures. American Journal of Epidemiology, 160(6), 509-516.

World Health Organization - WHO. (2020). Draft landscape of COVID-19 candidate vaccines - 03 September 2020. March, 01–09.

Zhou, P., Yang, X. Lou, Wang, X. G., Hu, B., Zhang, L., Zhang, W., Si, H. R., Zhu, Y., Li, B., Huang, C. L., Chen, H. D., Chen, J., Luo, Y., Guo, H., Jiang, R. Di, Liu, M. Q., Chen, Y., Shen, X. R., Wang, X., … Shi, Z. L. (2020). A pneumonia outbreak associated with a new coronavirus of probable bat origin. Nature, 579, 270–273. doi: 10.1038/s41586-020-2012-7

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Published

20/09/2020

How to Cite

FERREIRA, D. S. de A. .; LIMA, F. M. de; FREITAS, J. R. de; NASCIMENTO, G. I. L. A. .; ALVES , D. A. N. da S. .; GOMES, D. A.; AMARAL, L. S. do .; SANTOS, A. L. P. dos; SILVA JÚNIOR, A. F. da .; CUNHA, D. X. .; CUNHA, A. L. X.; PISCOYA, T. O. F.; ARAÚJO FILHO, R. N. de; HOLANDA, R. M. de; FRANÇA, M. V. de; MEDEIROS, R. M. de; COSTA, M. L. L. da; PISCOYA, V. C.; CUNHA FILHO, M.; MOREIRA, G. R. Transitivity of COVID-19, based on parameters R_0 and R_((t)) in Pombos/PE municipality, Brazil. Research, Society and Development, [S. l.], v. 9, n. 10, p. e1139108441, 2020. DOI: 10.33448/rsd-v9i10.8441. Disponível em: https://rsdjournal.org/index.php/rsd/article/view/8441. Acesso em: 23 dec. 2024.

Issue

Section

Agrarian and Biological Sciences