Flavonoides de plantas del género Lavandula como inhibidores potenciales de proteínas clave del SARS-CoV-2
DOI:
https://doi.org/10.33448/rsd-v10i12.20580Palabras clave:
SARS-CoV-2; Proteínas; Flavonoides; In silico.Resumen
Objetivo: evaluar el perfil de interacciones entre flavonoides frente a proteínas clave de la infección por SARS-CoV-2 y, en segundo lugar, analizar las propiedades de estos constituyentes químicos frente a la regla de Lipinski como posibles fármacos candidatos. Metodología: Este estudio se caracteriza por ser de tipo experimental descriptivo cuantitativo, mediante métodos computacionales, donde se utilizaron AutoDock Tools, AutoDock Vina, Biovia Discovery Studio y ChimeraX para realizar el acoplamiento molecular entre los principales flavonoides presentes en plantas del género Lavandula con la M proteína y el complejo entre la enzima convertidora de angiotensina-2 y el dominio de unión al receptor de proteína S del SARS-CoV-2. Resultados: Al analizar las interacciones aisladas de cada flavonoide con las proteínas, se observa que los compuestos resultaron más favorables con la enzima convertidora de angiotensina 2 y el dominio de unión al receptor. Para la regla de Lipinski, la delfinidina presentó dos violaciones, considerándose, en este contexto, una molécula poco prometedora. Conclusión: Se concluye, por tanto, que los flavonoides in silico presentan un potencial inhibidor de las proteínas ensayadas, siendo más favorables al complejo de la enzima convertidora de angiotensina 2 con el dominio de unión al receptor. En vista de la regla de Lipinski, solo Delphinidin mostró un bajo potencial como candidato a fármaco, sin embargo, el uso de nanoportadores podría eludir algunas de sus limitaciones.
Citas
Ali, A., & Vijayan, R. (2020). Dynamics of the ACE2–SARS-CoV-2/SARS-CoV spike protein interface reveal unique mechanisms. Scientific Reports, 10(1). https://doi.org/10.1038/s41598-020-71188-3
Almeida, D. F. L. dos S. (2017). Estudo das vias metabólicas das plantas na síntese de pigmentos naturais. [Master’s tesis] https://bdigital.ufp.pt/handle/10284/6104
Decaro, N., & Lorusso, A. (2020). Novel human coronavirus (SARS-CoV-2): A lesson from animal coronaviruses. Veterinary microbiology, 244, 108693. https://doi.org/10.1016/j.vetmic.2020.108693
Ferreira, A. R. A. (2014). Uso de óleos essenciais como agentes terapêuticos. [Master’s tesis] https://bdigital.ufp.pt/handle/10284/4513
Frecer, V., & Miertus, S. (2020). Antiviral agents against COVID-19: structure-based design of specific peptidomimetic inhibitors of SARS-CoV-2 main protease. RSC Advances, 10(66), 40244–40263. https://doi.org/10.1039/d0ra08304f
Gerhardt, T. E., & Silveira, D. T. (2009). Métodos de Pesquisa. Editora da UFRGS. http://hdl.handle.net/10183/52806
Gobbo-Neto, L., & Lopes, N. P. (2007). Plantas medicinais: fatores de influência no conteúdo de metabólitos secundários. Química Nova, 30(2), 374–381. https://doi.org/10.1590/s0100-40422007000200026
Gomes, J. N. S. (2019). Estudo in silico de derivados acrinídicos com potencial atividade antitumoral. Trabalho de Conclusão de Curso, Universidade Estadual da Paraíba, Campina Grande, Brasil.
Hamid, A. A., Aiyelaagbe, O. O., Usman, L. A. Essential oils: its medicinal and pharmacological uses. International Journal of Current Research, 3(2), 86-98. http://www.journalcra.com/sites/default/files/issue-pdf/406.pdf
Junior, V. F. V., Pinto, A. C., & Maciel, M. A. M. (2005, June). Plantas medicinais: cura segura? Química Nova, 28(3), 519-528. https://doi.org/10.1590/S0100-40422005000300026
Lis-Balchin, M. (2002). Lavender: The Genus Lavandula (Medicinal and Aromatic Plants - Industrial Profiles). (1st ed.). CRC Press.
Machado, B. F. M. T., & Junior, A. F. (2011). ÓLEOS ESSENCIAIS: ASPECTOS GERAIS E USOS EM TERAPIAS NATURAIS. Cadernos Acadêmicos, 3(2), 105–127. http://www.portaldeperiodicos.unisul.br/index.php/Cadernos_Academicos/article/view/718
Malik Y. A. (2020). Properties of Coronavirus and SARS-CoV-2. The Malaysian journal of pathology, 42(1), 3–11.
Mirza, M. U., & Froeyen, M. (2020). Structural elucidation of SARS-CoV-2 vital proteins: Computational methods reveal potential drug candidates against main protease, Nsp12 polymerase and Nsp13 helicase. Journal of Pharmaceutical Analysis, 10(4), 320–328. https://doi.org/10.1016/j.jpha.2020.04.008
Probst, I. S. (2014). Atividade antibacteriana de óleos essenciais e avaliação de potencial sinergético. [Master’s tesis]. https://repositorio.unesp.br/handle/11449/87926?show=full
Salum, L. B. (2007). Estudos in silico no planejamento de candidatos a novos fármacos na terapia do câncer de mama e de reposição hormonal. [Master’s tesis]. https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/76/76132/tde-09042008-121318/pt-br.php
Santos, A. L. P., Lima, G. W. R., & Moraes, C. A. P. (2019). Estudo do potencial do óleo essencial de Lavandula angustiofolia L. como antimicrobiano. InterfacEHS – Saúde, Meio Ambiente e Sustentabilidade, 14(1), 63–72. http://www3.sp.senac.br/hotsites/blogs/InterfacEHS/wp-content/uploads/2019/07/221_InterfaEHS_Artigo-63-72.pdf
SILVA, G. L. F. (2016). KNECHTEL, Maria do Rosário. Metodologia da pesquisa em educação: uma abordagem teórico-prática dialogada. Curitiba: Intersaberes, 2014 (Resenha). Praxis Educativa, 11(2), 531–534. https://doi.org/10.5212/praxeduc.v.11i2.0013
Silva, S. M. (2015). Sistemas agrícolas e adubação na biomassa e óleo essencial de lavanda (Lavandula dentata L.) [Doctoral dissertation]. Universidade Federal de Uberlândia. https://repositorio.ufu.br/handle/123456789/12080
Sousa, F. C. F., Melo, C. T. V., Citó, M. C. O., Félix, F. H. C., Vasconcelos, S. M. M., Fonteles, M. M. F., Barbosa Filho, J. M., & Viana, G. S. B. (2008). Plantas medicinais e seus constituintes bioativos: uma revisão da bioatividade e potenciais benefícios nos distúrbios da ansiedade em modelos animais. Revista Brasileira de Farmacognosia, 18(4), 642–654. https://doi.org/10.1590/s0102-695x2008000400023
Thomford, N. E., Senthebane, D. A., Rowe, A., Munro, D., Seele, P., Maroyi, A., & Dzobo, K. (2018). Natural Products for Drug Discovery in the 21st Century: Innovations for Novel Drug Discovery. International journal of molecular sciences, 19(6), 1578. https://doi.org/10.3390/ijms19061578
Viegas Jr, C., Bolzani, V. D. S., & Barreiro, E. J. (2006). Os produtos naturais e a química medicinal moderna. Química Nova, 29(2), 326–337. https://doi.org/10.1590/s0100-40422006000200025
Xavier, A. L. (2012). Design Teórico, Síntese Multicomponente e Comprovação Experimental da Atividade Antinociceptiva de Pirimidinonas em Camundongos através das vias Intraperitoneal e Oral. [Master’s tesis]. https://repositorio.ufpe.br/handle/123456789/11945
Yuki, K., Fujiogi, M., & Koutsogiannaki, S. (2020). COVID-19 pathophysiology: A review. Clinical immunology (Orlando, Fla.), 215, 108427. https://doi.org/10.1016/j.clim.2020.108427
Descargas
Publicado
Cómo citar
Número
Sección
Licencia
Derechos de autor 2021 José Gabriel Fontenele Gomes; Neirigelson Ferreira de Barros Leite
Esta obra está bajo una licencia internacional Creative Commons Atribución 4.0.
Los autores que publican en esta revista concuerdan con los siguientes términos:
1) Los autores mantienen los derechos de autor y conceden a la revista el derecho de primera publicación, con el trabajo simultáneamente licenciado bajo la Licencia Creative Commons Attribution que permite el compartir el trabajo con reconocimiento de la autoría y publicación inicial en esta revista.
2) Los autores tienen autorización para asumir contratos adicionales por separado, para distribución no exclusiva de la versión del trabajo publicada en esta revista (por ejemplo, publicar en repositorio institucional o como capítulo de libro), con reconocimiento de autoría y publicación inicial en esta revista.
3) Los autores tienen permiso y son estimulados a publicar y distribuir su trabajo en línea (por ejemplo, en repositorios institucionales o en su página personal) a cualquier punto antes o durante el proceso editorial, ya que esto puede generar cambios productivos, así como aumentar el impacto y la cita del trabajo publicado.