Secuencias retrovirales de interés en Medicina Veterinaria identificadas en murciélagos urbanos de la Amazonia

Autores/as

DOI:

https://doi.org/10.33448/rsd-v11i10.32993

Palabras clave:

Viroma; Chiroptera; Metagenómica; Illumina.

Resumen

Los murciélagos son reservorios de una gran variedad de virus. Entre los virus registrados en los murciélagos, los retrovirus se encuentran entre las familias de virus más significativas porque causan una infección persistente en los animales. Los informes recientes sobre los retrovirus que circulan en las poblaciones de murciélagos han identificado varios retrovirus de otros animales en estos mamíferos. Este estudio tuvo como objetivo identificar secuencias retrovirales de interés en medicina veterinaria en especies de murciélagos urbanos de la región amazónica, utilizando la metagenómica viral. A partir de la secuenciación de nueva generación (NGSS) en la plataforma Illumina y basándonos en BLAST (Basic Local Alignment Search Tool), analizamos 168 muestras (56 de sangre, 56 de hisopo oral y 56 de hisopo anal) de 56 murciélagos de las especies Noctilio albiventris (n=18), N. leporinus (n=1), Artibeus lituratus (n=13), Myotis sp. (n=6) y Molossus molossus (n=18). Como resultado observamos que cuatro géneros de retrovirus tenían lecturas, estos son: Alfaretrovirus, Betaretrovirus, Gammaretrovirus y Lentivirus. Los grupos de hisopos orales presentaron un mayor número de contigs virales identificados por similitud en BLAST. Las secuencias retrovirales totales fueron las siguientes: Duck infectious anemia virus, Feline leukemia virus, Gibbon ape leukemia virus, Avian leukosis virus, Reticuloendotheliosis virus, Feline mmunodeficiency virus, Mason Pfizer monkey virus, Enzootic nasal tumour virus of goat e Simian retrovirus Y. Demostramos, a partir de nuestro análisis metagenómico, que hay circulación de retrovirus de otros reservorios, como felinos, ovejas y aves, en la quiropterofauna de la región e informamos de tales registros para alertar sobre la vigilancia permanente de los murciélagos en busca de nuevos retrovirus y las investigaciones de las características biológicas y el potencial infeccioso de tales virus.

Citas

Baker, K. S., Leggett, R. M., Bexfield, N. H., Alston, M., & Daly, G. (2013). Metagenomic study of the viruses of African straw-coloured fruit bats: Detection of a chiropteran poxvirus and isolation of a novel adenovirus. Virology, 441, 95–106.

Cui, J., Tachedjian, G., Tachedjian, M., Holmes, E.C., & Zhang, S. (2012a). Identification of diverse groups of endogenous gammaretroviruses in mega- and microbats. Journal of General Virology, 93, 2037–2045. https://doi.org/10.1099/vir.0.043760-0.

Cui, J., Tachedjian, G., & Wang, L.F. (2015). Bats and Rodents Shape Mammalian Retroviral Phylogeny. Scientific Reports, 9(5), 165561.

Cui, J., Tachedjian, M., Wang, L., Tachedjian, G., & Wang, L. F. (2012b). Discovery of retroviral homologs in bats: implications for the origin of mammalian gammaretroviruses. Journal of Virology, 86, 4288–4293. https://doi.org/10.1128/JVI.06624-11.

Denget, X., Naccache, S. N., Nig, T., Federman, S., Li, L., Chiu, C.Y., & Delwart, E.L. (2015). An ensemble strategy that significantly improves de novo assembly of microbial genomes from metagenomic next-generation sequencing data. Nucleic Acids Research, 20, 43(7), 46. 10.1093/nar/gkv002.

Delwart, E. L. (2007). Viral metagenomics. Reviews in medical virology, 17 (2), 115–131. https://doi.org/10.1002/rmv.532.

Goff, S. P. (2013). Retroviridae. In Fields Virology. (pp1424-1473). Edited by D. M. Knipe & P. M. Howley: Lippincott, Williams & Wilkins.

Hayward, J. A., Grabherr, M., & Jern, P. (2013). Broad-scale phylogenomics provides insights into retrovirus-host evolution. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 10(50), 20146-51. 10.1073/pnas.1315419110.

Hayward, J. A., Tachedjian, M., Cui, J., Field, H., Holmes, E.C., Wang, L.F. & Tachedjian, G. (2013). Identification of diverse full-length endogenous betaretroviruses in megabats and microbats. Retrovirology, 27, 10-35. 10.1186/1742-4690-10-35.

Hayward, J. A., Tachedjian, M., Kohl, C., Johnson, A., Dearnley, M., Jesaveluk, B., & Nitsche, A. (2020). Infectious KoRV-related retroviruses circulating in Australian bats. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 28 (17), 9529-9536. 10.1073/pnas.1915400117.

Hayward, J. A., & Tachedjian, G. (2021). Retroviruses of Bats: a Threat Waiting in the Wings? Sociedade Americana de Microbiologia mBio, 26(5), 19-41. 10.1128/mBio.01941-21.

Hayman, D. T. (2016). Bats as Viral Reservoirs. Annual Review of Virology, 29 (1), 77-99. 10.1146/annurev-virology-110615-042203.

MCginnis, S., & Thomas, L. M. (2004). “BLAST: at the core of a powerful and diverse set of sequence analysis tools.” Nucleic acids research, 32, 20-25. https://doi.org/10.1093/nar/gkh435

McMichael, L., Smith, C., Gordon, A., Agnihotri, K., Meers, J., & Oakey, J. (2019). A novel Australian flying-fox retrovirus shares an evolutionary ancestor with Koala, Gibbon and Melomys gamma-retroviruses. Virus Genes, 55(3), 421-424. 10.1007/s11262-019-01653-3.

Mollentze, N., & Streicker, D. G. (2020). Viral zoonotic risk is homogenous among taxonomic orders of mammalian and avian reservoir hosts. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 28(17), 9423-9430. 10.1073/pnas.1919176117.

Reis, J. K. P. (2012). Retroviroses Animais. Cadernos Técnicos de Veterinária e Zootecnia. 64, 65-76.

Stoye, J. P. (2012). Studies of endogenous retroviruses reveal a continuing evolutionary saga. Nature Reviews Microbiology, 8(6), 395-406. 10.1038/nrmicro2783.

Tachedjian, G., Hayward, J. A., & Cui, J. (2015). Bats and reverse transcribing RNA and DNA viruses (pp 177–201. In Wang L-F. Cowled C (ed), Bats and viruses: a new frontier of emerging infectious diseases. John Wiley & Sons, Inc, Hoboken, NJ. 10.1002/9781118818824.ch7.

Tarlinton, R. E., Meers, J., & Young, P. R. (2006). Retroviral invasion of the koala genome. Nature. 442, 79–81.

Publicado

05/08/2022

Cómo citar

ABREU, W. U. .; RODRIGUES, L. R. R. .; COSTA, A. C. da .; MORAIS, V. dos S. .; PAULA, A. C. de .; BARREIROS, E. A. . Secuencias retrovirales de interés en Medicina Veterinaria identificadas en murciélagos urbanos de la Amazonia. Research, Society and Development, [S. l.], v. 11, n. 10, p. e394111032993, 2022. DOI: 10.33448/rsd-v11i10.32993. Disponível em: https://rsdjournal.org/index.php/rsd/article/view/32993. Acesso em: 23 nov. 2024.

Número

Sección

Ciencias Agrarias y Biológicas