Selección in silico de compuestos semiáridos de Bahía para identificar inhibidores potenciales de la proteína MAPK p38
DOI:
https://doi.org/10.33448/rsd-v9i10.8723Palabras clave:
Simulación del acoplamiento molecular, Inflamación, Proteínas quinasas p38 activadas por mitógenos.Resumen
La proteína p38 participa en la síntesis de citocinas proinflamatorias IL1 y TNF-alfa, principalmente, siendo importante en el mantenimiento y la amplificación del proceso inflamatorio. Por lo tanto, esta proteína presenta alto potencial como diana farmacológica en la búsqueda de nuevos tratamientos para las enfermedades inflamatorias. Una forma rápida y barata las nuevas moléculas bioactivas de descubrimiento es mediante la realización de estudios in silico. El objetivo de este estudio es la identificación de compuestos de moléculas semiáridos noreste con potencial actividad inhibidora de la proteína p38 MAPK, a través de acoplamiento molecular. La estructura cristalográfica de la proteína se obtuvo sobre la base de datos de macromoléculas Protein Data Bank. Las moléculas semiáridas del noreste se obtuvieron de la base de datos de ZINC. Entre las moléculas disponibles en la base de datos, se seleccionaron sólo 233 estudios de acoplamiento molecular, una vez que encajan en los parámetros de la regla de Lipinski y Verber. El acoplamiento se llevó a cabo utilizando el programa Autodock Vina en su configuración predeterminada. El código de la molécula ZINC 69481892 fue seleccionado como prometedor con respecto a la inhibición de la proteína p38 MAPK, puesto que la energía de enlace con la p38 fue -11.1 Kcal.mol-1. El análisis de las interacciones intermoleculares demostró que las interacciones de Van der Waals son cruciales para la molécula ZINC 69481892 en el sitio activo de la proteína. Datos resultantes de los atraques son importantes, aunque tiene baja precisión. Así, los hipotéticos resultados de estos estudios in silico deben confirmarse por pruebas in vitro o in vivo.
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