Avaliação in silico do efeito inibitório dos antirretrovirais Atazanavir e Darunavir sobre a principal protease do SARS-CoV-2: estudos de docking e dinâmica molecular
DOI:
https://doi.org/10.33448/rsd-v9i8.6562Palavras-chave:
Ancoragem molecular; Inibidor da protease; Uso de medicamentos.Resumo
O SARS-CoV-2 faz parte de uma família vírus de RNA novamente descrito em 2019, sendo o causador da doença Covid-19. A integração de estratégias computacionais tem grande importância na identificação e desenvolvimento de novos compostos promissores. Atazanavir e Darunavir, foram projetados para combater a resistência a fármacos mutantes principalmente por meio do aumento do número de interações polares com os principais átomos da cadeia da protease do HIV. Este estudo visa avaliar a interação molecular dos fármacos Atazanavir e Darunavir com a principal protease do SARS-CoV-2 através de estudos de docking e dinâmica molecular. Trata-se de um estudo descritivo, do tipo experimental com uma abordagem quali-quantitativa sobre o tema. Para tanto utilizando-se dos programas BIOVIA Discovery Studio, PyMol, AutoDock Tools 1.5.6, AutoDock Vina, foram realizadas a modelagem e simulação de ancoragem do fármaco no local de ação. Foram demonstradas pontuações menores, sendo -7.0 (Darunavir) a mais próxima do Inibidor UAW 247. É possível perceber que os fármacos demonstraram ligações residuais semelhantes, também, em relação à estrutura da protease, a molécula testada mais próxima foi o Atazanavir. Levando em consideração a estabilidade dos valores RMSD, é válido inferir que em relação ao inibidor UAW 247, o fármaco Atazanavir é aquele que melhor se assemelha, ao contrário do Darunavir, que apresenta variações maiores. Os dois fármacos encaixaram no local de ligação devido principalmente, a interações eletrostáticas e pontes de hidrogênio. O Atazanavir é o que mais se assemelha à atividade molecular, e o Darunavir é o que apresenta melhor pontuação de ancoragem.
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