Evaluación in silico del efecto inhibitorio de los antirretrovirales Atazanavir y Darunavir sobre la proteasa principal del SARS-CoV-2: estudios de acoplamiento y dinámica molecular
DOI:
https://doi.org/10.33448/rsd-v9i8.6562Palabras clave:
Anclaje molecular; Inhibidor de protease; Uso de medicinas.Resumen
El SARS-CoV-2 es parte de una familia de virus de ARN descrita nuevamente en 2019, que causa la enfermedad de Covid-19. La integración de estrategias computacionales es de gran importancia en la identificación y desarrollo de nuevos compuestos prometedores. Atazanavir y Darunavir, fueron diseñados para combatir la resistencia a las drogas mutantes principalmente aumentar el número de interacciones polares con átomos principales en cadena de la proteasa del VIH. Este estudio tiene como objetivo evaluar la interacción molecular de los medicamentos Atazanavir y Darunavir con la proteasa principal del SARS-CoV-2 através de estudios de acoplamiento y dinámica molecular. Este es un estudio descriptivo, experimental con un enfoque cuali-cuantitativo sobre el tema. Para ello, utilizando los programas BIOVIA Discovery Studio, PyMol, AutoDock Tools 1.5.6, AutoDock Vina, se realizó el modelado y simulación del anclaje del fármaco en sitio de acción. Se demostraron puntuaciones más bajas, siendo -7.0 (Darunavir) más cercano al inhibidor UAW 247. Es posible notar que los fármacos mostraron conexiones residuales similares, también, en relación con estructura de la proteasa, la molécula probada más cercana fue Atazanavir. Teniendo en cuenta la estabilidad de los valores de RMSD, es válido inferir que, en relación con el inhibidor de UAW 247, el medicamento Atazanavir es el que mejor se asemeja, el Darunavir, presenta mayores variaciones. Las dos drogas encajan en el sitio de unión principalmente debido a interacciones electrostáticas y enlaces de hidrógeno. Atazanavir es más similar a la actividad molecular, y Darunavir es el que tiene mejor puntuación de anclaje.
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