Variabilidad genética de Colletotrichum sublineolum através de marcadores ISSR

Autores/as

DOI:

https://doi.org/10.33448/rsd-v10i2.12223

Palabras clave:

Sorghum biocolor (L.) Moench; Antracnosis; Marcadores moleculares.

Resumen

La aparición de enfermedades es un factor limitante en el desarrollo del cultivo de sorgo. Entre las enfermedades que ocasionan pérdidas en la producción de sorgo, la antracnosis es la principal y más grave, principalmente por la variabilidad genética del patógeno. En este contexto, el objetivo de este estudio fue evaluar la variabilidad genética de aislados de Colletotrichum sublineolum. Se extrajo ADN de 56 aislados monospóricos de C. sublineolum utilizando un kit de extracción de ADN, y para realizar el análisis de diversidad genética de los aislados se utilizaron cebadores ISSR. Después de la amplificación, se determinó el contenido de información polimórfica (PIC), la frecuencia alélica, los análisis de agrupamiento de UPGMA y Tocher y, utilizando el software Structure, la estructura genética. Según el análisis descriptivo de la variabilidad genética de los aislados de C. Sublineolum, el cebador AP1 presentó el mayor valor de contenido de información polimórfica (PIC). La mayor frecuencia alélica se observó en los loci 06, 09, 10 y 24, y la menor en el locus 02. En cuanto al método de agrupamiento, se observó una tendencia a agrupar los aislados de C. sublineolum según el origen geográfico y, además de demostrando la variabilidad genética entre los aislados de C. sublineolum, se observó la ocurrencia de introgresión entre los aislados.

Citas

Abbott, R., et al. (2013). Journal of Evolutionary Biology, 26(2), 229–246. https://doi.org/10.1111/j.1420-9101.2012.02599.x.

Andrade, E. M. Uesugi, C. H. Ueno, B. & Ferreira, M. A. S. V. (2007). Caracterização morfocultural e molecular de isolados de Colletotrichum gloeosporioides patogênicos ao mamoeiro. Fitopatologia Brasileira, 32(1), 21-31. https://doi.org/10.1590/S0100-41582007000100003.

B. SEIFERT

Benitez, L. C. Rodrigues, I. C. S. Arge, L. W. P. Ribeiro, M. V. & Braga, E. J. B. (2011). Análise multivariada da divergência genética de genótipos de arroz sob estresse salino durante a fase vegetativa. Revista Ciência Agronômica, 42(2), 409-416.

Bertran, I. Carvalho, F. I. F. Oliveira, A. C. Vieira, E. A. Hartwig, I. Silva, J. A.G. Shimidt, D. A. M. Valério, I. P. Busato, C. C. & Ribeiro, G. (2006) Comparação de métodos de agrupamento na representação da distância morfológica entre genótipos de trigo. Revista Brasileira Agrociência, 12(3), 279-286. https://doi.org/10.18539/CAST.V12I3.4554.

Botstein, D. White, R. L. & Skolmick, H. (1980). Construction of a genetic linkage map in man using restriction fragment length polymorphisn. American Journal of Human Genetics, 32(3), 314-331.

Boza, E. J. Irish, B. M. Meerow, A. W. Tondo, C. L. Rodriguez, O. A. Ventura-López, M. Gomez, J. A. Moore, J. M. Zhang, D. Motamayor, J. C. & Schnell, R. J. (2013). Genetic diversity, conservation, and utilization of Theobroma cacao L.: genetic resources in the Dominican Republic. Genetic Resources and Crop Evolution 60:605–619. https://doi.org/10.1007/s10722-012-9860-4.

Caixeta, E. T. Oliveira, A. C. B. Brito, G. G. Sakiyama, N. S. (2009) Tipos de marcadores moleculares. In: BORÉM, A.; Caixeta, E. T. Marcadores moleculares. 2.ed. Viçosa: UFV. pp. 11-94.

Cardwel, K. F. Hepperly, P. R. & Frederikisen, R. A. (1989). Pathotypes of Colletotrichum graminicola and seed transmission of sorghum anthracnose. Plant Disease, 73:255-257.

Casela, C. R. & Frederiksen, R. A. (1994). Pathogenic variability in monoconidial isolates of the sorghum antracnose fungus Colletotrichum graminicola from single lesions and from monoconidial cultures. Fitopatologia Brasileira, 19(2), 149-153.

Casela, C. R. Santos, F. G. & Ferreira, A. S. (2000) Associação de patogenicidade e diversidade fenotípica de Colletotrichum graminicola, agente causal da antracnose em sorgo. Fitopatologia Brasileira, 25(3), 517‑521.

Castro, F. M. R.; Potencial Agronômico e Energético de Híbridos de Sorgo Biomassa. Lavras: UFLA, 2014. 80p. Dissertação (Mestrado em Fitotecnia).

Conab - Companhia nacional de abastecimento. Estimativa da produção de grãos no Brasil. http://www.conab.gov.br

Conab - Companhia nacional de abastecimento. Perspectiva para Agropecuária. Volume 3 – Safra 2015/2016. Produtos de Verão.

Costa, R. V. Casela, C. R. Zambolim, L. & Ferreira, A. S. (2003) A antracnose do sorgo. Fitopatologia brasileira, 28(4),345-354. https://doi.org/10.1590/S0100-41582003000400001.

Cruz, C. D. & Carneiro, P. C S. (2003) Modelos biométricos aplicados ao melhoramento genético. UFV.

Cruz, C. D. & Regazzi, A. J. (2001) Modelos biométricos aplicados ao melhoramento genético. UFV.

Cruz, C.D. (2013). GENES - a software package for analysis in experimental statistics and quantitative genetics. Acta Scientiarum, 35(3), 271-276. https://doi.org/10.4025/actasciagron.v35i3.21251.

Evanno, G. Regnaut, S. & Goudet, J. (2005). Detecting the number of clusters of individuals using the software structure: a simulation study. Molecular Ecology, 14(8), 2611-2620. https://doi.org/10.1111/j.1365-294X.2005.02553.x.

Freeman, S. Katan, T. & Sabhi, E. (1998). Characterization of Colletotrichum species responsible for anthracnose diseases of various fruits. Plant Disease, 82(6), 596-605. https://doi.org/10.1094/PDIS.1998.82.6.596.

G. HEWITT

INO

J. B. W. WOLF

J. BOUGHMAN

LA

MARCZEWSKI

Panizzi, R. C. & Fernandes, N. G. (1997). Doenças do sorgo. In: Camargo, E. A., Rezende, J. A. M. (Eds.). Manual de Fitopatologia - Doenças das Plantas Cultivadas. São Paulo: Editora Agronômica Ceres. pp. 676-689.

Parreira, D. F. Zambolim, L. Gomes, E. A. Costa, R. V. Silva, D. D. Lana, U. G. P. Neves, W. S. Figueiredo, J. E. F. & Cota, L. V. (2016). Diversidade genética estimada através de marcadores issr de Colletotrichum graminicola no Brasil. Revista Brasileira de Milho e Sorgo 15(2), 186-194. http://dx.doi.org/10.18512/1980-6477/rbms.v15n2p186-194.

Parreira, D. F. ZAmbolim, L. Gomes, E. A. Costa, R. V. Silva, D. D. Cota, L. V. Lana, U. G. P. & Silva, E. C. F. Estimativa da Diversidade Genética de Colletotrichum graminicola com Marcadores ISSR. In: XXVIII CONGRESSO NACIONAL DE MILHO E SORGO. Goiânia, 2010. Anais... Goiânia: Associação Brasileira de Milho e Sorgo. 2010. p.731-739.

Pereira, I. S. Silva, D. da D. Casela, C. R. Tardin, F. D. & ABREU, M. de S. (2011). Resistência de linhagens genitoras e híbridos simples de sorgo a Colletotrichum sublineolum, agente causal da antracnose. Revista Caatinga, 24(2), 46‑51.

Perumal, R. Ninmkayala, P. Erattamuthu, S.R. NO, Eun-Gyu.; Reddy, U.K.; Prom, L.K.; Odvody, G.N.; Luster, D.G. & Magill, C.W. (2008). Simple sequence repeat markers useful for 1-14. http://dx.doi.org/10.1186/1471-2156-9-77.

Pritchard, J. K. & Wen W. Documentation for structure software: Version 2.1, 2004. http://pritch.bsd. uchicago.edu.

R. NICHOLS

Rohlf, F. J. (1970) Adaptive hierarchical clustering schemes. Systematic Zoology, 19(1), 58-82. https://doi.org/10.1093/sysbio/19.1.58.

Rossi, F. S. Rossi, A. A. B. Dardengo, J. F. E. Brauwers, L. R. Silva, M. L. da. & Sebbenn, A. M. (2014). Diversidade genética em populações naturais de Mauritia flexuosa L. f. (Arecaceae) com uso de marcadores ISSR. Scientia Florestalis, 42(104), 631-639.

Santos, P. C. M. Lima, W. G. Bezerra, C. S. Michereff, S. J. & Câmara, M. P. S. (2015) Diversidade genotípica e patogênica de Colletotrichum musae no estado de Pernambuco. Revista Brasileira de Fruticultura 37(2), 355-366. https://doi.org/10.1590/0100-2945-034/14.

Silva, D. D. Casela, C. R. Castro, H. A. Santos, F. G. & Ferreira, A. S. (2008). Diversidade populacional de Colletotrichum sublineolum, em seis localidades no Brasil. Summa Phytopathologica, 34(2), 149-155. https://doi.org/10.1590/S0100-54052008000200007.

Silva, D. D. Resistência de híbridos de sorgo e diversidade de Colletotrichum sublineolum. Lavras: UFLA, 2009. 175 p. (Tese – Doutorado em Fitopatologia).

ST

U. DIECKMANN

Zietkiewicz, E. Rafalski, A. & Labuda, D. (1994). Genome fingerprinting by simple sequence repeat (SSR)-anchored polymerase chain reaction amplification. Genomics. 20(2), 176-183. https://doi.org/10.1006/geno.1994.1151.

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Publicado

10/02/2021

Cómo citar

GUIMARÃES , T. S. .; BARELLI, M. A. A. .; CORRÊA , C. L. .; SILVA, V. P. da .; FLORIANO , A. J. S. .; SANDER , N. L. .; DUARTE , A. V. M. .; ZAGO , B. W. .; RIBEIRO , J. L. B. .; TARDIN , F. D. .; SILVA, D. D. da . Variabilidad genética de Colletotrichum sublineolum através de marcadores ISSR. Research, Society and Development, [S. l.], v. 10, n. 2, p. e20210212223, 2021. DOI: 10.33448/rsd-v10i2.12223. Disponível em: https://rsdjournal.org/index.php/rsd/article/view/12223. Acesso em: 30 jul. 2024.

Número

Sección

Ciencias Agrarias y Biológicas