Triagem in silico de compostos oriundos do semiárido baiano para identificação de potenciais inibidores da proteína p38 MAPK
DOI:
https://doi.org/10.33448/rsd-v9i10.8723Palavras-chave:
Simulação de Acoplamento Molecular; Inflamação; Proteínas quinases p38 ativadas por mitógeno.Resumo
A proteína p38 está envolvida na síntese de citocinas proinflamatórias, principalmente IL1 e TNFα, sendo importante na manutenção e amplificação dos processos inflamatórios. Assim, esta proteína apresenta elevado potencial como alvo farmacológico na busca por novos tratamentos de doenças inflamatórias. Uma forma rápida e de baixo custo para a descoberta de novas moléculas bioativas é através da realização estudos in silico. Com isso, o objetivo deste estudo é a identificação de compostos oriundos do semiárido baiano com potencial atividade inibitória da proteína p38 MAPK, através de estudos de acoplamento molecular. A estrutura cristalográfica da proteína foi obtida no banco de estruturas de macromoléculas Protein Data Bank. As moléculas do semiárido nordestino foram obtidas através do banco de dados ZINC. Dentre as moléculas disponíveis, apenas 233 foram selecionadas para os estudos de acoplamento molecular, uma vez que enquadraram-se nos parâmetros das regras de Lipinski e Verber. O docking foi realizado utilizando o programa Autodock Vina em sua configuração padrão. A molécula de código ZINC 69481892 foi a única selecionada como promissora no que diz respeito à inibição da proteína p38 MAPK, já que a energia de ligação com a p38 foi -11,1 Kcal.mol-1. Analises das interações intermoleculares demonstraram que as interações de Van der Waals são cruciais para a ligação da molécula ZINC 69481892 no sitio ativo da proteína. Estes dados resultantes da realização de dockings são significativos, entretanto de baixa acurácia. Assim, os resultados hipotéticos dos estudos in sílico devem ser confirmados por estudos in vitro e/ou in vivo.
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