Caracterización in silico de isoformas del gen de lacasa de Basidiomycetes comestibles y medicinales
DOI:
https://doi.org/10.33448/rsd-v9i12.10388Palabras clave:
Agaricus; Isogenes; Lentinus; Pleurotus; Hongos de pudrición blanca.Resumen
Las lacasas son parte de la familia de enzimas ligninolíticas y desempeñan funciones esenciales en varios procesos biológicos de hongos filamentosos, incluso la formación de cuerpos fructíferos y la degradación de la lignina. El objetivo general fue identificar y caracterizar genes del lacasa in silico de varias cepas de Basidiomycetes. La prueba de oxidación con guayacol aplicada permitió la selección de siete de las 11 cepas con actividad ligninasa, que se utilizaron para la extracción del ADN y la amplificación de la región de conexão al cobre. Todas las cepas seleccionadas produjeron un único amplicón de aproximadamente 450 pb que fueron posteriormente secuenciados. El análisis de la secuencia sugirió la presencia de una nueva subdivisión de los genes de lacasa. El análisis de agrupamiento confirmó la existencia de dos grupos: el cluster A con seis cepas y el singleton B con la cepa U8-11. Las predicciones estructurales de la proteína U8-11 fueron diferentes en comparación con otras proteínas descritas en nuestro estudio debido a la ausencia del motif ALAVIN y, por lo tanto, la secuencia de aminoácidos U8-11 se separó en un cluster diferente.
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