Análise quali-quantitativa do DNA genômico extraído de folha e estipe de x Butyagrus nabonnandii (Prosch.) Vorster

Autores

DOI:

https://doi.org/10.33448/rsd-v11i10.33005

Palavras-chave:

Arecaceae; Extração de DNA; Nitrogênio líquido; Rendimento do DNA; Palmeira híbrida.

Resumo

Ferramentas de identificação baseadas em DNA são de suma importância em estudos genéticos de plantas, onde o isolamento e a purificação são passos cruciais. O objetivo do presente estudo foi testar a eficiência de métodos de conservação e de maceração de materiais biológicos na extração de DNA genômico de folha e estipe de x Butyagrus nabonnandii (Prosch.) Vorster. Os dados foram analisados com ajuda do software Genes via análise de variância, considerando o esquema fatorial 3x2x2x2, com três repetições (três espécimes do híbrido; dois tipos de material biológico, estipe e folha; dois tipos de conservação, fresco e desidratado; dois tipos de maceração, com e sem nitrogênio líquido). As médias foram analisadas pelo teste Tukey a 5% de probabilidade de erro. O DNA genômico foi avaliado por espectrofotometria para determinar a concentração. A integridade foi determinada por eletroforese em gel de agarose. Foram utilizados dois primers da família gênica WRKY para testar a qualidade do DNA obtido em reações de PCR. As análises estatísticas revelaram diferenças significativas nas concentrações de DNA entre os métodos avaliados. Obteve-se maiores quantidades de DNA a partir da extração de folhas frescas quando comparadas às folhas desidratadas. O rendimento do DNA a partir de estipe fresco e desidratado não variou entre os métodos testados. O uso de nitrogênio líquido pode ser dispensado, conforme resultado dos padrões das bandas nas reações de PCR. Foi possível extrair DNA de qualidade e quantidades suficientes dos materiais biológicos de x B. nabonnandii, que amplificaram as regiões genômicas de interesse.

Referências

Aboul-Maaty, N, A. & Oraby, H. A. (2019). Extraction of high-quality genomic DNA from different plant orders applying a modified CTAB-based method. Bulletin of the National Research Centre, 43 (25), 1-10.

Arif, I. A., Bakir, M. A., Khan, H. A., Ahamed, A., Farhan, A. H. A., Homaidan, A. A. A., Sadoon, M. A., Bahkali, A. H. & Shobrak, M. (2010). A simple method for DNA extraction from mature date palm leaves: impact of sand grinding and composition of lysis buffer. International Journal of Molecular Sciences, 11, 3149-3157.

Aydın, Z. U., Şenova, M. K., Koch, M. A. & Dönmez, A. A. (2020). DNA from Leaf or Stem: A Comparative Work on Dianthus L. for DNA Barcoding Analysis with Four Commercial Extraction Kits. Hacettepe Journal of Biology and Chemistry, 48 (4), 333-339.

Azêvedo, H. S. F. S., Rufino, P. B., Azevedo, J. M. A., Silva, L. M. S., WAdt, L. H. O. & Campos, T. (2019). Preservação e maceração de tecido de folíolos de açaí da Amazônia para obtenção de DNA genômico. Bioscience Journal, 35 (4), 1188-1197.

Barbosa Rodrigues, J. (1903). Sertum Palmarum Brasiliensium. Imprimerie Typographique Veuve Monnm, 2 (1),116.

Burret, M. (1940). Um caso de hibridação entre Arecastrum romanzoffianum e Butia capitata. Rodriguesia, 13, 170-173.

Carvalho, M. S., Noia, L. R., Ferreira, M. F. S. & Ferreira, A. (2019). DNA de alta qualidade isolado a partir do córtex de Euterpe edulis Mart. (Arecaceae). Ciência Florestal, 29 (1), 396-402.

Colpaert, S. C., Bandou, E., Caron, H., Gheysen, G. & Lowe, A. J. (2005). Sampling tissue for DNA analysis of trees trunk cambium as an alternative to canopy leaves. Silvae Genetica, 54 (6), 265-269.

Cruz, C. D. (2016). Genes software – extended and integrated with the R, Matlab and Selegen. Acta Scientiarum, 38 (4), 547-552.

Furtado Filho, J. C., Silva, J. N., Viana, J. P. G., Costa, M. F., Sousa, C. C., Gomes, M. F. C, Lopes, A. C. A. & Valente, S. E. S. (2021). Comparação de métodos de isolamento do DNA em Handroanthus Serratifolius. Brazilian Journal of Development, 7 (4), 35765-35779.

Hedge, S., Pai, S. R. & Roy, S. (2017). Combination of DNA isolation and RP-HPLC analysis method for bark samples of Saraca asoca and its adulterant. Biotech, 7 (208), 208.

Ihase, L. O., Horn, R., Anoliefo, G. O, Eke, C. R., Afolab, A. B. & Asemota, O. (2016). Development of a method for DNA extraction from oil palm leaves and the effects of pH and ionic strengh on nucleic acid quantification. Journal of Biological Methods, 3 (2), e37.

Laindorf, B. L., Metz, G. F., Küster, M. C. T., Lucini, F., Freitas, K. E. J., Victória, F. C. & Pereira, A. B. (2019). Transfer of microsatellite markers from other Arecaceae species to Syagrus romanzoffiana (Arecaceae). Genetics and Molecular Research, 18 (3), gmr18183.

Lanes, E. C. M., Nick, C., Kuki, K. N., Freitas, R. D. & Motoike, S. Y. (2013). Genomic DNA isolation of Acrocomia aculeata (Arecaceae) from leaf and stipe tissue samples for PCR analysis. Genetics and Molecular Research, 12 (3), 3905-3911.

Lorenzi, H., Noblick, L. R., Kahn, F. & Ferreira, E. (2010). Flora Brasileira: Arecaceae (Palmeiras). Instituto Plantarum, Nova Odessa, 214-255.

Mangaravite, E., Terra, V., Hattori, E. K. O, Dal’sasso, T. C. S, Bhering, L. L. & Oliveira, L. O. (2020). A feasible method to extract DNA from the cambium of high-canopy trees: from harvest to assessment. Acta Amazonica, 50, 335-338.

Mauro-Herrera, M., Meerow A. W., Borrone, J. W., Kuhn, D. N. & Schnell, R. J. (2006) Ten informative markers developed from WRKY sequences in coconut (Cocos nucifera). Molecular Ecology Notes, 6, 904–906.

Meerow, A. W., Noblick, L., Borrone, J. W., Couvreur, T. L. P., Mauro-Herrera, M., Hahn W. J., Kuhn, D. N., Nakamura, K., Oleas, N. H. & Schnell, R. J. (2009). Phylogenetic analysis of seven WRKY Genes across the palm Subtribe Attaleinae (Arecaceae) identifies Syagrus as sister group of the coconut. Plos ONE, 4 (10), e7353.

Mello, L. M., Reiniger, L. R., Meneghello, G. E., Villela, F. A. & Mota, M. S. (2015). Isolamento de DNA genômico a partir de folhas e câmbio congelados de Erythrina crista-galli L., FABACEAE (Corticeira-do-banhado). Revista Thema, 12 (02), 82-93.

Mo, X. C. & Wangsomnuk, P. P. (2021). A modified non-liquid nitrogen protocol for extraction of high-quality genomic DNA from the inner bark tissues of Dalbergia cochinchinensis (Fabaceae). Genetics and Molecular Research, 20 (2), gmr18836.

Novaes, R. M. L., Rodrigues, J. G. & Lovato, M. B. (2009). An efficient protocol for tissue sampling and DNA isolation from the stem bark of Leguminosae trees. Genetics and Molecular Research, 8 (1), 86-96.

Proschowsky, A. R. (1921). Un beau palmier hybride: Butiarecastrum nabonnandi. Revue Horticole, 93, 290–291.

Soares, K. P., Longhi, S. J., Witeck Neto, L. & Assis, L. C. (2014). Palmeiras (Arecaceae) no Rio Grande do Sul, Brasil. Rodriguésia, 65 (1), 113-139.

Tan, H., Tie, M., Zhang, L., Zhu, Y. & Li, H. (2013). The effects of three diferente grinding methods in DNA extraction of cowpea (Vigna unguiculata L. Walp). African Journal of Biotechnology, 12 (16), 1946-1951.

Downloads

Publicado

11/08/2022

Como Citar

OLIVEIRA-NEVES, P. de .; PEREIRA, A. B.; CAÑEDO, A. D.; SOUZA, V. Q. de; LAINDORF, B. L.; AZAMBUJA, M. B.; ROSA, L. Z. da. Análise quali-quantitativa do DNA genômico extraído de folha e estipe de x Butyagrus nabonnandii (Prosch.) Vorster . Research, Society and Development, [S. l.], v. 11, n. 10, p. e572111033005, 2022. DOI: 10.33448/rsd-v11i10.33005. Disponível em: https://rsdjournal.org/index.php/rsd/article/view/33005. Acesso em: 22 nov. 2024.

Edição

Seção

Ciências Agrárias e Biológicas